Endemic Taxa in Juan Fernández rainforest
- Abrotanella linearifolia A.Gray
- Argyrochosma chilensis (Fée & J. Rémy) Windham
- Arthropteris altescandens (Colla) J. Sm.
- Asplenium macrosorum Bertero ex Colla
- Azara serrata Ruiz & Pav. var. fernandeziana (Gay) Reiche
- Berberis corymbosa Hook. & Arn.
- Berberis masafuerana Skottsb.
- Boehmeria excelsa (Bertero ex Steud.) Wedd.
- Carex berteroniana Steud.
- Centaurodendron schilleri Penneck., N. Garcia & Susanna
- Cranfillia longicauda (C.Chr.) Gasper & V.A.O.Dittrich
- Dicksonia berteroana (Colla) Hook.
- Dicksonia externa C. Chr. & Skottsb.
- Elaphoglossum skottsbergii Krajina
- Hymenophyllum cuneatum Kunze var. cuneatum
- Hymenophyllum cuneatum Kunze var. rariforme C. Chr. & Skottsb.
- Hymenophyllum rugosum C. Chr. & Skottsb.
- Juania australis (Mart.) Drude ex Hook.f
- Lardizabala biternata Ruiz & Pav.
- Lomaridium schottii (Colla) Gasper & V.A.O.Dittrich
- Megalastrum inaequalifolium (Colla) A.R.Sm. & R.C.Moran
- Megalastrum masafuerae Sundue, Rouhan & R.C. Moran
- Polypodium masafuerae Phil.
- Polystichum tetragonum Fée
- Pteris berteroana J. Agardh
- Synammia intermedia (Colla) G.Kunkel ssp. intermedia
- Thyrsopteris elegans Kunze
- Trichomanes exsectum Kunze
- Trichomanes ingae C. Chr. & Skottsb.