Ñuble, que se creó recién en 2018, limita con la Región del Maule al norte y la Región del Biobío al sur, y en términos de superficie es la más pequeña de Chile. La cordillera de Ñuble se encuentra dentro del hotspot de biodiversidad del Centro-Sur de Chile, una zona de transición entre bosques esclerófilos y bosques templados del sur. Como tal, tiene una alta diversidad de especies endémicas, pero la mayoría de los hábitats están amenazados por la degradación ambiental debido a la construcción de represas hidroeléctricas, plantaciones forestales, actividades agrícolas y mineras. Irónicamente, incluso dentro de la Reserva de la Biosfera del Corredor Biológico Nevados de Chillán-Laguna del Laja, que fue declarada por la UNESCO en 2011, los hábitats están gravemente amenazados. Recientemente se descubrió un nuevo género endémico en esta reserva que comprende la especie Rayenia malalcurensis; esta se encontró creciendo junto a otras especies endémicas como guindo santo (Eucryphia glutinosa), y su descubrimiento destaca una vez más el alto valor en términos de biodiversidad del hotspot chileno y la urgencia de conservación frente a las amenazas del cambio climático y otras actividades humanas. Irónicamente, cerca de la reserva se encuentra el valle de San Fabián, que contiene otro curso de agua que se perderá debido a la construcción de una represa hidroeléctrica, lo que resultará en la pérdida de 1000 árboles de una conífera altamente amenazada, el lleuque (Prumnopitys andina).
Taxones endémicos en Ñuble
- Acaena trifida Ruiz & Pav. var. trifida
- Acmispon subpinnatus (Lag.) D.D.Sokoloff
- Acrisione denticulata var. pilota (Phil.) B.Nord.
- Adenopeltis serrata (W.T. Aiton) I.M. Johnst.
- Adesmia araucana Phil.
- Adesmia concinna Phil.
- Adesmia davilae Phil.
- Adesmia denticulata Clos
- Adesmia elata Clos
- Adesmia filicaulis Phil.
- Adesmia landbecki Phil.
- Adesmia microcalyx var. calvescens Burkart
- Adesmia mucronata Hook. & Arn.
- Adesmia propinqua Clos
- Adesmia viscida Bertero ex Colla
- Adiantum excisum Kunze
- Adiantum sulphureum Kaulf. var. majus Hook
- Agrostis trisetoides Steud.
- Alstroemeria hookeri Lodd. ssp. hookeri
- Alstroemeria hookeri Lodd. ssp. sansebastiana Baeza & E. Ruiz
- Alstroemeria ligtu L. ssp. ligtu
- Alstroemeria presliana Herb. ssp. australis Ehr. Bayer
- Alstroemeria revoluta Ruiz & Pav.
- Alstroemeria versicolor Ruiz & Pav.
- Anaphalis chilensis Reiche
- Antidaphne punctulata (Clos) Kuijt
- Asplenium obtusatum G. Forst. var. sphenoides (Kunze) C. Chr. ex Skottsb.
- Asteriscium chilense Cham. & Schltdl.
- Astragalus berteri Colla
- Azara celastrina D.Don
- Azara dentata Ruiz & Pav.
- Azara integrifolia Ruiz & Pav.
- Azara petiolaris (D. Don) I.M.Johnst.
- Azara serrata Ruiz & Pav. var. serrata
- Azorella spinosa (Ruiz & Pav.) Pers.
- Baccharis paniculata DC.
- Baccharis rhomboidalis J. Rémy
- Baccharis vernalis F.H.Hellwig
- Bahia ambrosioides Lag.
- Beilschmiedia berteroana (Gay) Kosterm.
- Berberis actinacantha Mart. ex Schult. & Schult.f.
- Berberis chilensis Gillies ex Hook. & Arn. var. chilensis
- Berberis rotundifolia Poepp. & Endl.
- Berberis valdiviana Phil.
- Bipinnula volkmannii Kraenzl.
- Blechnum asperum (Klotzsch) J.W. Sturm
- Blennosperma chilense Less.
- Blepharocalyx cruckshanksii (Hook. & Arn.) Nied.
- Calceolaria alba Ruiz & Pav.
- Calceolaria cana Cav.
- Calceolaria corymbosa Ruiz & Pav. ssp. corymbosa
- Calceolaria corymbosa Ruiz & Pav. ssp. tetraphylla (Phil.) C. Ehrh.
- Calceolaria integrifolia L.
- Calceolaria meyeniana Phil. ssp. glabrata (Phil.) C. Ehrh.
- Calceolaria talcana Grau & C.Ehrh.
- Calycera leucanthema (Poepp. ex Less.) Kuntze
- Carex multifaria (Nees ex Boott) J.R.Starr
- Chaetanthera ciliata Ruiz & Pav.
- Chaptalia exscapa (Pers.) Baker var. chilensis (DC.) Burkart
- Chascolytrum koelerioides (Trin.) Essi, Longhi-Wagner & Souza-Chies
- Chiropetalum berterianum Schltdl. var, berterianum
- Chloraea bletioides Lindl.
- Chloraea chrysantha Poepp.
- Chloraea crispa Lindl.
- Chloraea galeata Lindl.
- Chloraea gavilu Lindl.
- Chloraea lamellata Lindl.
- Chloraea longipetala Lindl.
- Chloraea multiflora Lindl.
- Chloraea nudilabia Poepp.
- Chusquea cumingii Nees
- Chusquea quila Kunth
- Cissarobryon elegans Kunze ex Poepp.
- Cistanthe grandiflora (Lindl.) Schltdl.
- Citronella mucronata (Ruiz & Pav.) D. Don
- Clarkia tenella (Cav.) F.H. Lewis & M.R. Lewis ssp. araucana D.M. Moore & F.H. Lewis
- Clarkia tenella (Cav.) F.H.Lewis & M.R.Lewis ssp. ambigua (Phil.) D.M.Moore & F.H.Lewis ex Marti
- Colliguaja dombeyana A. Juss.
- Conanthera bifolia Ruiz & Pav.
- Conanthera campanulata Lindl.
- Conanthera parvula (Phil.) M.Muñoz
- Conanthera trimaculata (D. Don) F. Meigen
- Convolvulus chilensis Pers.
- Conyza gayana Phil.
- Conyza stenophylla Phil.
- Conyza thermarum Phil.
- Corynabutilon viride (Phil.) A. Martic
- Crinodendron patagua Molina
- Cryptantha glomerata Lehm. ex Fisch. & C.A. Mey. ssp. glomerata
- Cryptocarya alba (Molina) Looser
- Danthonia chilensis E. Desv. var. aureofulva (E. Desv.) Baeza
- Deschampsia monandra Parodi
- Desmaria mutabilis (Poepp. & Endl.) Tiegh. ex T.Durand & B.D.Jacks.
- Dioscorea auriculata Poepp.
- Dioscorea bridgesii Griseb. ex Kunth
- Dioscorea humifusa Poepp. var. gracilis (Hook. & Arn.) L.E. Navas
- Dioscorea humifusa Poepp. var. humifusa
- Dioscorea nana Poepp.
- Dioscorea pedicellata Phil.
- Dioscorea saxatilis Poepp.
- Dioscorea stenocolpus Phil.
- Eleocharis uniflora Seberg
- Equisetum pyramidale Goldm.
- Ercilla spicata (Bertero) Moq.
- Eryngium depressum Hook. & Arn.
- Eryngium polyrhizum Clos
- Eryngium rostratum Cav.
- Escallonia florida Poepp. ex DC.
- Escallonia illinita C. Presl
- Escallonia pulverulenta (Ruiz & Pav.) Pers. var. glabra Engl.
- Escallonia pulverulenta (Ruiz & Pav.) Pers. var. pulverulenta
- Escallonia revoluta (Ruiz & Pav.) Pers.
- Escallonia rubra (Ruiz & Pav.) Pers. var. macrantha (Hook. & Arn.) Reiche
- Eucryphia glutinosa (Poepp. & Endl.) Baill.
- Euphrasia trifida Poepp. ex Benth.
- Fascicularia bicolor (Ruiz & Pav.) Mez ssp. bicolor
- Fascicularia bicolor (Ruiz & Pav.) Mez ssp. canaliculata E.C.Nelson & Zizka
- Francoa appendiculata Cav.
- Galium araucanum Phil.
- Gamocarpha polycephala Phil.
- Gamochaeta aliena (Hook. & Arn.) Cabrera
- Gamochaeta procumbens (Phil.) Cabrera
- Gamochaeta valparadisea (Phil.) Anderb.
- Gardoquia gilliesii Graham
- Gardoquia multiflora Ruiz & Pav.
- Gavilea longibracteata (Lindl.) Sparre ex L.E. Navas
- Gavilea venosa (Lam.) Garay & Ormd.
- Geum quellyon Sweet
- Gilliesia montana Poepp. & Endl.
- Glandularia berteroi (Schauer) M. Muñoz
- Gochnatia foliolosa (D. Don) D. Don ex Hook. & Arn. var. fascicularis (D. Don) Cabrera
- Gochnatia foliolosa (D. Don) D. Don ex Hook. & Arn. var. foliolosa
- Gomortega keule (Molina) Baill.
- Grausa micrantha (Poepp.) Weigend & R.H.Acuña
- Greigia sphacelata (Ruiz & Pav.) Regel
- Griselinia jodinifolia (Griseb.) Taub.
- Griselinia scandens (Ruiz & Pav.) Taub.
- Haplopappus humilis (Phil.) Reiche
- Haplopappus macrocephalus (Poepp. ex Less.) DC.
- Haplopappus setulosus Klingenb.
- Haplopappus stolpii Phil.
- Helenium glaucum (Cav.) Stuntz
- Hydrocotyle poeppigii DC.
- Hypochaeris spathulata (J. Rémy) Reiche var. spathulata
- Jovellana violacea (Cav.) G. Don
- Juncus acuminatus Michx. var. multiceps (Kunze ex Kunth) Barros
- Kageneckia oblonga Ruiz & Pav.
- Lapageria rosea Ruiz & Pav.
- Lardizabala biternata Ruiz & Pav.
- Lathyrus berteroanus Colla ex Savi
- Lathyrus subandinus Phil
- Laurelia sempervirens (Ruiz & Pav.) Tul.
- Legrandia concinna (Phil.) Kausel
- Lepechinia chilensis (Molina) R.Morales
- Leptocarpha rivularis DC.
- Leucocoryne alliacea Miers ex Lindl.
- Leucocoryne ixioides (Hook.) Lindl.
- Libertia sessiliflora (Poepp.) Skottsb.
- Libertia tricocca Phil.
- Linum chamissonis Schiede
- Linum macraei Benth. var. macraei
- Linum macraei Benth. var. marticorenae Mildner
- Lithraea caustica (Molina) Hook. & Arn.
- Loasa triloba Dombey ex Juss.
- Luma chequen (Molina) A.Gray
- Luzuriaga polyphylla (Hook.) J.F. Macbr.
- Madia chilensis (Nutt.) Reiche
- Melica commersonii Nees ex Steud.
- Microphyes minima (Miers ex Colla) Briq.
- Micropsis nana DC.
- Miersia minor Kunth
- Montiopsis sericea (Hook. & Arn.) D.I. Ford
- Moscharia pinnatifida Ruiz & Pav.
- Mutisia ilicifolia Cav. var. ilicifolia Cav.
- Mutisia macrophylla Phil.
- Mutisia subulata Ruiz & Pav. fma. rosmarinifolia (Poepp. & End.) Cabrera
- Myrceugenia colchaguensis (Phil.) L.E.Navas
- Myrceugenia lanceolata (Juss. ex J. St.-Hil.) Kausel
- Myrceugenia leptospermoides (DC.) Kausel
- Myrceugenia obtusa (DC.) O.Berg
- Myrceugenia parvifolia (DC.) Kausel
- Nassella barbinodis (Phil.) Ciald., M. Muñoz & Morrone
- Nassella duriuscula (Phil.) Barkworth
- Nassella gibba (Phil.) M.Muñoz
- Nassella macrathera (Phil.) Barkworth
- Nassella parodii (Matthei) Barkworth
- Nassella pfisteri (Matthei) Barkworth
- Nicotiana acuminata (Graham) Hook. var. multiflora (Phil.) Reiche
- Nolana paradoxa Lindl.
- Notanthera heterophylla (Ruiz & Pav.) G. Don
- Nothofagus glauca (Phil.) Krasser
- Noticastrum eriophorum J.Rémy
- Ochagavia andina (Phil.) Zizka, Trumpler & Zoellner
- Ochagavia carnea (Beer) L.B. Sm. & Looser
- Oenothera acaulis Cav.
- Olsynium junceum (E.Mey. ex C.Presl) Goldblatt subsp. depauperatum (Phil.) R.Rodr. & Martic.
- Olsynium nigricans (Phil.) R.Rodr. & Martic.
- Olsynium scirpoideum (Poepp.) Goldblatt subsp. scirpeum (Phil.) R.Rodr. & Martic.
- Ourisia coccinea (Cav.) Pers. ssp. elegans (Phil.) Meudt
- Ourisia polyantha Poepp. & Endl.
- Oxalis arenaria Bertero ex Colla
- Oxalis aureoflava Steud.
- Oxalis clandestina Phil.
- Oxalis dumetorum Barnéoud
- Oxalis rosea Jacq.
- Oziroe arida (Poepp.) Speta
- Peumus boldus Molina
- Phalaris amethystina Trin.
- Phycella australis Ravenna
- Phycella chilensis (L’Hér.) Grau ex Nic.García
- Piptochaetium angolense Phil.
- Piptochaetium depressum (Steud.) C. Peña
- Pitavia punctata (Ruiz & Pav.) Molina
- Plagiobothrys foliosus I.M.Johnst.
- Plagiobothrys fulvus (Hook. & Arn.) I.M. Johnst.
- Plagiobothrys polycaulis (Phil.) I.M. Johnst.
- Plagiobothrys uliginosus (Phil.) I.M. Johnst.
- Plantago firma Kunze ex Walp.
- Plantago hispidula Ruiz & Pav.
- Plantago truncata Cham. & Schltdl.
- Podanthus mitiqui Lindl.
- Podanthus ovatifolius Lag.
- Podocarpus salignus D.Don
- Polygala gayi A.W. Benn.
- Proustia pyrifolia DC.
- Prumnopitys andina (Poepp. ex Endl.) de Laub.
- Pseudognaphalium gayanum (J.Rémy) Anderb.
- Pteris chilensis Desv.
- Puya alpestris (Poepp.) Gay ssp. alpestris
- Rayenia malalcurensis Menegoz & A.E. Villarroel (2011)
- Retanilla ephedra (Vent.) Brongn.
- Rhamnus diffusus Clos
- Rhodophiala flava (Phil.) Traub
- Rhodophiala rosea (Sweet) Traub
- Ribes bicolor Phil.
- Ribes densiflorum Phil.
- Ribes trilobum Meyen
- Rumex maricola J.Rémy
- Rytidosperma quirihuense Baeza
- Sabulina acutiflora (Fenzl ex Endl.) Dillenb. & Kadereit
- Sagittaria montevidensis Cham. & Schltdl. ssp. chilensis (Cham. & Schltdl.) Bogin
- Sarmienta scandens (J.D.Brandis ex Molina) Pers.
- Schinus patagonicus (Phil.) I.M.Johnst. ex Cabrera var. crenuloides (F.A.Barkley) F.A.Barkley
- Scyphanthus elegans Sweet
- Senecio arnicoides Hook. & Arn.
- Senecio calocephalus Poepp.
- Senecio chillanensis Cabrera
- Senecio haloragis J.Rémy var. haloragis J.Rémy
- Senecio lastarrianus J.Rémy
- Senecio linariifolius Poepp. ex DC. var. aclonetus (Phil.) Cabrera
- Senecio nigrescens Hook. & Arn.
- Senecio phylicaefolius Poeep. ex DC.
- Senecio portalesianus J.Rémy var. lanuginosus (Phil.) Cabrera
- Senna stipulacea (Aiton) H.S. Irwin & Barneby var. anglorum H.S. Irwin & Barneby
- Senna stipulacea (Aiton) H.S. Irwin & Barneby var. stipulacea
- Solenomelus pedunculatus (Gillies ex Hook.) Hochr.
- Sophora cassioides (Phil.) Sparre
- Sophora macrocarpa Sm.
- Spergularia cerviana (Cham. & Schltdl.) G.Don
- Stachys grandidentata Lindl.
- Stachys macraei Benth.
- Stachys ochroleuca Phil.
- Stachys pannosa Phil.
- Stachys philippiana Vatke
- Stachys sericea Cav.
- Stellaria chilensis Pedersen
- Sticherus squamulosus (Desv.) Nakai var. squamulosus
- Teucrium bicolor Sm.
- Trevoa quinquenervia Gillies & Hook.
- Trichocline aurea (D.Don) Reiche
- Triptilion spinosum Ruiz & Pav.
- Tristagma bivalve (Hook. ex Lindl.) Traub
- Tristagma violaceum (Kunth) Traub
- Tropaeolum brachyceras Hook. & Arn.
- Tropaeolum ciliatum Ruiz & Pav. ssp. septentrionale Sparre
- Tropaeolum myriophyllum (Poepp. & Endl.) Sparre
- Tropaeolum nuptae-jucundae Sparre
- Tropaeolum tricolor Sweet
- Tweedia birostrata (Hook. & Arn.) Hook. & Arn.
- Ugni candollei (Barnéoud) O.Berg
- Ulantha grandiflora (Poepp.) Szlach.
- Valeriana bracteosa Phil.
- Valeriana grandifolia Phil.
- Valeriana obtusifolia DC.
- Valeriana praecipitis A.E. Villarroel & Menegoz
- Valeriana valdiviana Phil.
- Vicia araucana Phil
- Viola capillaris Pers. var. araucana (Phil.) Reiche
- Viola portalesia Gay var. portalesia
- Viola pusilla Poepp.
- Zephyranthes advena (Ker Gawl.) Nic.García
- Zephyranthes araucana (Phil.) Nic.García
Taxones endémicos que solo se encuentran en Ñuble
- Eleocharis uniflora Seberg
- Gamocarpha polycephala Phil.
- Mutisia macrophylla Phil.
- Olsynium scirpoideum (Poepp.) Goldblatt subsp. scirpeum (Phil.) R.Rodr. & Martic.
- Rayenia malalcurensis Menegoz & A.E. Villarroel (2011)
- Tristagma violaceum (Kunth) Traub
- Valeriana praecipitis A.E. Villarroel & Menegoz
- Vicia araucana Phil